Χιλιάδες φορολογούμενοι έχουν λάβει εκκαθαριστικά σημειώματα του ΦΑΠ 2011 και του ΦΑΠ 2012 με λάθην στον υπολογισμό του φόρου, τα περισσότερα εκ των οποίων σχετίζονται με την φορολογητέα αξία των ακινήτων.
Οι ιδιοκτήτες που έχουν εντοπίσει λάθη στον ΦΑΠ 2011 και 2012 έχουν προθεσμία 4 μηνών από την ημέρα εκκαθάρισης της δήλωσης τους για να κάνουν δίορθωση του ΦΑΠ .
Μέχρι και σήμερα οι φορολογούμενοι που έχουν διαπιστώσει λάθη στο εκκαθαριστικό τους επισκέπτονται την εφορία τους και καταθέτουν αίτηση διόρθωσης του ΦΑΠ προσκομίζοντας τα απαραίτητα δικαιολογητικά. Εφόσον η αίτηση τους γίνεται αποδεκτή, η αρμόδια ΔΟΥ προβαίνει σε νέα εκκαθάριση της δήλωσης σε εύλογο χρονικό διάστημα .
Για να μην δημιουργούνται ουρές στις εφορίες το υπουργείο Οικονομικών δημιούργησε ηλεκτρονική εφαρμογή για τις διορθώσεις εκκαθαριστικών Φόρου Ακίνητης Περιουσίας απλοποιώντας τη διαδικασία. Η εφαρμογή για την διόρθωση του ΦΑΠ 2011 2012 ευρίσκεται ήδη σε δοκιμαστική λειτουργία και ότι μέσα στις επόμενες ημέρες θα δοθεί προς χρήση στο κοινό.