Το νέο αποδυναμωμένο ΣΔΟΕ αποτελείται πλέον από περίπου 150 υπαλλήλους, οι οποίοι θα έχουν ως αποκλειστική αρμοδιότητα τον έλεγχο ειδικών υποθέσεων που σχετίζονται με τα λαθρεμπορία.
Το τέλος του ΣΔΟΕ έχει προκαλέσει έντονες αντιδράσεις μεταξύ των υπαλλήλων σχετικά με τα κριτήρια που ελήφθησαν υπόψιν για τη μεταφορά τους σε άλλες υπηρεσίες.
Η δυσφορία έχει να κάνει κυρίως με το πως αρκετοί ελεγκτές με πολύχρονο αντικείμενο ενασχόλησης σοβαρών υποθέσεων μεταφέρονται και τοποθετούνται σε εφορίες και τελωνεία.